
封面故事:人类遗传结构的百科全书
ENCODE项目即所谓的“DNA元素百科全书”项目,其中ENCODE所代表的是“ENCyclopedia Of DNA Elements”。该项目旨在识别人类基因组中所有功能元素。现在人类基因组序列已经确定,所以下一个挑战是弄清细胞实际上是怎样将其作为一本“说明书”来使用的。ENCODE课题组已经完成了该项目的“原理证明”试点阶段的工作,即对人类基因组中1%的目标区域中的功能元素进行分析的工作。发表在本期Nature上的分析结果表明,人类基因组中的大多数碱基对存在于初级转录版本中,包括非蛋白编码转录版本和重叠的版本。对转录调控所作的分析,使我们对转录起始点有了新的了解,对染色质的结构也有了更成熟的认识。将这些数据整合起来,尤其是就哺乳动物演化而言,可以为我们提供关于DNA蓝图中所编码的信息是怎样被转化成活细胞中的功能系统的新线索。
火星海岸线的新解释
关于火星上是否有海洋的问题是一个非常吸引人的话题。当环绕火星平原的一组表面特征被解释为由以前的海岸线留下的遗迹时,一切似乎都已经清楚。但沿假设中的海岸线的地形轮廓却显示出高程上的长波趋势,高度变化达几公里。这个结果与海岸线假设是相矛盾的。不过现在,海洋假说又突然回来了。Perron等人发现,极地偏移(火星表面相对于其转动轴的取向所发生的一个变化)可以解释其海岸线的变形。
用微RNA进行基因沉默研究
本期Nature上两篇论文报告了关于用微RNA(miRNAs)来进行基因沉默的研究结果。微RNA是指调控信使RNA稳定性和转录的小RNA。Chendrimada等人发现,三分子复合物RISC(该复合物已知能产生微RNA)与MOV10复合物发生相互作用,后者包括核糖体抗关联因子eIF6。这一发现表明,eIF6所起的作用是在演化过程中保留下来的、由微RNA引导的基因沉默的调控因子。Rolf Thermann 和 Matthias Hentze发现,果蝇的微RNA“miR2”通过生成与核糖体非常相似的大miRNA复合物来阻止蛋白形成,而锁进所形成的“假多核糖体”中的信使RNA的作用便被有效阻止了。
是否超新星SN 2006jc?
当一个明亮的光学瞬态于2004年10月在UGC 4904星系被发现时,种种迹象表明,其大小和亮度都大到足以被认为是一颗超新星。进一步的研究工作表明,它还不是非常符合这样一个尺度的要求,但差不多在其被发现正好两年之后,它似乎又像是超新星了:超新星SN 2006jc在天空的位置正好是早先的这个光学瞬态所在的地方。这是这样一种双爆发首次被观测到的。一种可能性是,最初的瞬态是来自一颗Wolf-Rayet恒星的一次爆发,该恒星是一颗非常热的、正在迅速失去质量的巨大恒星。另一种可能性是,该系统也许是一个双星体系,包含一颗明亮的蓝色变星,它于2004年爆发;两年之后一颗相伴的Wolf-Rayet恒星作为超新星SN 2006jc爆发。
人类活动对森林生态系统的影响
对西欧和美国的森林生态系统所作的一项研究解决了一个长期存在的争议,同时也提出了很多新问题。所研究的问题是,氮沉积对全球碳循环的影响,尤其是人类活动所扮演的角色。这项新的研究表明,通过森林管理的直接影响,以及通过氮肥的使用和汽车及工业等所产生的氮氧化物的间接影响,人类活动对碳平衡或生态系统的净生产(即生态系统通过光合作用所进行的固碳作用及碳随后通过植物和土壤呼吸所进行的排放之间的平衡)具有一个深远的、基本上是积极的效应。在为这篇论文所配发的News and Views中,Peter Hgberg考虑了这些发现对于诸如为森林施用氮肥的做法是否正确等实际问题的意义。
眼睛微小运动的功能
凝视性眼睛运动指的是眼睛不自觉的微小运动,或称“视网膜抖动”,是在我们盯住某个东西看时发生的。这种运动的功能自其在上个世纪50年代首次被发现以来一直是一个有争议的问题。Rucci等人通过将心理物理实验与对进入眼睛、以抵消眼睛运动的视觉效应的视觉信号所作的统计分析结合起来,发现如果没有这些运动,我们对细微信息的感知就会降低。这表明,凝视性眼睛运动是大脑用来从视觉信息中提取细节内容的一个策略的构成部分。
自噬作用与泛素—蛋白酶体系统之间的关系
对于一个细胞来说,要除去随着时间推移所积累的不合适的蛋白主要有两个通道:泛素—蛋白酶体系统和自噬作用,后者指的是通过一个细胞自身的溶酶体细胞器来使该细胞自己的组成部分自我破坏。用泛素—蛋白酶体系统已被瓦解了的一种神经退化疾病的果蝇模型所作的研究表明,自噬作用可以补偿这种损失。两个蛋白破坏通道在体内是联系在一起的,与微管相关的组蛋白去乙酰化酶HDAC6充当二者之间的联系。HDAC6的表达足以诱发自噬作用,使果蝇的神经退化得以挽救。这些发现反映了自噬作用与泛素—蛋白酶体系统之间的关系,并且对于了解与蛋白有关的神经退化疾病的发病机理及可能的治疗方法也有参考意义。
(田天/编译,更多信息请访问www.naturechina.com/st)
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