8月7日深夜至8月8日凌晨，甘肃省甘南藏族自治州舟曲县因强暴雨导致发生特大泥石流，造成重大人员伤亡和财产损失。灾情传来，引起中科院物理研究所广大职工、研究生的高度关注和深切同情，大家急切地希望能助灾区人民一臂之力，共度难关。

8月17日下午，物理所党委接到京区党委、院工会《关于向甘肃舟曲灾区捐款的通知》后，高度重视，周密部署，联合工会、研究生会第一时间通过所网站、邮件通知全所，号召大家积极行动起来，自觉自愿捐款，为急需帮助的灾区人民送去温暖和希望。物理所各党支部、分工会纷纷响应，所领导、院士、科研骨干率先垂范，一笔笔承载着爱心的善款在短时间内便汇集起来。由于此次捐款时间紧、任务急，许多具体负责的同志放弃午休时间清点捐款数额，出差在外的同志特地打来电话委托他人代交，行动不便的老同志也托付别人送来捐款。

截至8月19日中午，全所参加捐款764人，捐款共计69528.55元，所有款项已于当天下午交至京区党委，统一转往灾区。