国际知名药理专家、美国杜克大学教授王小凡根据自己对中国科学院的多年观察，详细阐述了他对新时期中国科学院的建议。

他在征文《建设有中国特色的中国科学院》中表示，从历史上讲，中国科学院当初仿效苏联的做法而建立，不同于西方国家的国家科学院，例如美国国家科学院就不是一个实体研究机构，而只是一个顾问机构。因为有这样的历史原因，中科院应博采众家之长，走自己的路，建成一个有中国特色的学术研究院。

他认为中科院应该有三个主要作用：“第一是在基础科学知识上进行创新，第二是在核心技术上有所突破，第三是在国家重大科学工程上发挥集团军的尖兵作用。这三个作用同等重要、相互联系、缺一不可。为了发挥这些重要作用，中科院应该建立合理的评估制度和与之相适应的人事制度，组建一支有国际竞争力的优秀队伍，成为走在科学技术发展前沿的先遣队。”