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“这个项目始于2017年,我对新基因的进化感兴趣,想弄清楚这些基因的起源。”论文第一作者、希腊亚历山大·弗莱明生物医学研究中心的Nikolaos Vakirlis说,“但它被搁置了几年,直到另一项研究发表,其中有一些非常有趣的数据促使我们重启了这项工作。”
利用之前发表的与功能相关的新基因数据集,研究人员创建了比较人类与其他脊椎动物物种的祖先图谱。他们追踪了这些基因在进化过程中的关系,发现155个基因来自独特的DNA区域。虽然新基因可以从基因组中已经存在的复制事件中产生,但这些基因却是从零开始产生的。
论文通讯作者、爱尔兰都柏林大学三一学院的Aoife McLysaght说:“如此新颖的研究令人兴奋。当开始研究这些微小的DNA时,你会发现它们处于基因组序列可以解释的边缘,很难知道它是否具有生物学意义。”
在这155个新基因中,有44个与细胞培养中发生的生长缺陷有关,证明了这些基因在维持生命系统健康方面的重要性。由于这些基因是人类特有的,因此很难直接检测。研究人员必须寻找另一种方法来探索这些新基因可能对身体产生的影响。Vakirlis团队通过DNA标记检查了这些基因是否在特定疾病中发挥作用。
研究发现,这155个新基因中有3个具有与疾病相关的DNA标记,这些标记指向肌肉萎缩症、色变性视网膜炎和Alazami综合征等疾病。此外,研究人员还发现了一种与人类心脏组织有关的新基因。这种基因在人类和黑猩猩从大猩猩中分离出来后就出现了,这显示了一个基因进化得有多快,才能成为身体的必需品。
“在未来的研究中,了解这些微基因可能的作用,以及它们是否直接参与任何一种疾病,将是非常有趣的。”Vakirlis说。
“这些基因很容易被忽视,因为它们很难研究,但我认为,人们会越来越深刻地认识到,它们需要被关注和考虑。”McLysaght说,“如果我们的观点是正确的,那么人类基因组可能隐藏着更多功能性的东西。”
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111808
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