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《细胞—代谢》
科学家绘制小鼠糖尿病肾病单细胞转录组图谱
美国华盛顿大学Benjamin D. Humphreys研究组绘制了小鼠糖尿病肾病(DKD)对治疗反应的单细胞转录组图谱。相关论文近日发表在《细胞—代谢》杂志上。
研究人员使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了鼠DKD模型对5种治疗方案的反应。约100万个细胞的图谱显示所有肾细胞类型对DKD及其治疗的异质反应。单一疗法和联合疗法都针对不同的细胞类型,并诱导不同且不重叠的转录变化。钠—葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂(SGLT2i)对近端小管S1段的早期影响表明该类药物可诱导禁食模拟和缺氧反应。糖尿病下调了近端小管中的剪接体调节因子丝氨酸/精氨酸丰富的剪接因子7(Srsf7),而SGLT2i专门拯救了该剪接体调节因子。
Srsf7的体外近端小管敲低诱导促炎表型,暗示选择性剪接是DKD的驱动因素,并表明SGLT2i调节近端小管选择性剪接是该类药物的潜在作用机制。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.cmet.2022.05.010
《细胞—干细胞》
淋巴管是调节肠道干细胞活动的信号枢纽
美国霍华德·休斯医学院Elaine Fuchs和Dana Pe’er研究组合作发现,淋巴管是调节肠道干细胞(ISCs)活动的信号中枢。相关论文发表于近日出版的《细胞—干细胞》杂志上。
研究人员报告了与 ISC 密切相关的肠隐窝底部的淋巴网络。利用体内功能丧失和淋巴管—类器官共培养,他们发现隐窝淋巴管维持ISC并抑制其早熟分化。将单细胞和空间转录组学配对,他们应用贝叶斯棱镜对空间特征内的表达进行去卷积,并开发SpaceFold以在高分辨率下稳健地绘制生态位图,将淋巴管作为一般隐窝和ISC的中央信号枢纽。他们将 WNT 信号因子和迄今为止未被重视的细胞外基质蛋白REELIN,确定为直接控制ISC再生潜力的隐窝淋巴信号。
据悉,ISC对其局部微环境作出反应,以满足对组织更新的持续需求。这些生态位和潜在通信途径的复杂性尚不完全清楚。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.stem.2022.05.007
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