7月24日,来自英国约翰-英纳斯研究中心和美国佐治亚大学植物遗传育种与基因组学研究所植物生物学系的Katrien M. Devos教授为中国科学院昆明植物研究所师生带来了一场题为Exploiting comparative genomics for trait mapping in non-model crop species的精彩学术报告。报告由所长李德铢主持。
Katrien教授介绍到柳枝稷(Panicum virgatum)是一种可用于提炼燃料乙醇的能源植物。由于多倍化和杂合性,导致柳枝稷的全基因组测序拼接工作困难重重。为了解决这些困难,Katrien教授及其研究团队通过构建柳枝稷的遗传图谱,并以谷子(Setaria italica)基因组为参考,利用比较基因组学的方法,来提高柳枝稷基因组的拼接质量,为分离与生物能源相关的关键基因提供重要基础信息。她指出柳枝稷和谷子基因组表现出高度的共线性;并且两者分化后,谷子基因组中至少发生了6个倒转(inversion)和1个易位(translocation)。Katrien教授还详细介绍了他们利用比较基因组学的方法,通过与高粱基因组进行比对,成功定位和分离了珍珠粟(Pennisetum glaucum)品种矮化性状基因(d2 dwarfs)。珍珠粟d2 矮化基因与高粱dw3 基因和玉米Br2基因为直系同源,它与其等位基因D2 高个基因主要的不同在于两个LTR逆转录转座子分别位于其外显子和启动子中。该基因的发现将有助于作物育种者培育农场主和牧场主所青睐的更高效的半矮秆珍珠粟品种。
最后,Katrien教授就大家提出的问题做出了详尽的建议和解答。