6月24日,欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)Senay Kafkas博士和在读博士Ying Yan(严嬴)等应邀访问中科院上海生命科学信息中心(以下简称“信息中心”)。
Senay Kafkas博士是EMBL-EBI的高级工程师,主要从事生物信息学、生物医学领域的文本挖掘工作,曾参与EuropePMC 项目,在Plos ONE等国际知名杂志上发表过多篇文章。Ying Yan为EMBL-EBI与剑桥大学联合培养的在读博士生,主要从事生物信息学、生物医学领域的文本挖掘工作。
访问期间,两位参观了信息中心各业务部门,并与信息中心“中国生物学文摘数据库(CBA)”部主任陈恒博士就未来进行数据库合作进行了深入和详细的探讨,并达成合作研究意向。
随后,Senay Kafkas博士和Ying Yan分别作了题为Interaction Variability of Human Protein Isoforms Identified through Biomedical Literature Mining和Identifying Bioactivity Event of Small Molecules from Biomedical Text的学术报告,重点介绍了EMBL-EBI目前的发展状况及在文本和知识挖掘领域的工作进展,如何使用TBIID挖掘生物医学文献中的人类蛋白异构体的互作关系,以及生物医学文献中小分子生物活性关系研究。
学术报告会由陈恒博士主持,来自信息中心和计算学生物学所的职工、研究生和报告者进行了交流互动。 |