华南植物园葛学军研究员负责的“中秘生物多样性合作研究与能力建设合作计划”获得中国科学院国际合作局批准，纳入2009年度中国科学院对外合作重点项目支持计划。这是该园首次承担中国科学院对外合作重点项目。

该项目合作方为秘鲁国立农业大学，项目将首次对南美洲亚马逊地区热带雨林进行大规模综合考察、采集，旨在：通过与秘鲁科学家合作进行亚马逊流域上游热带雨林生物多样性资源考察和系统研究，以及邀请秘鲁科研人员访华进行培训、留学，以及举办热带/亚热带雨林生物多样性跨国界保护与管理研修班等措施，以提高秘鲁科研人员及研究生科研水平，加深中秘双方了解，为长远合作奠定基础；通过对亚马逊流域上游热带雨林生物多样性本底调查，为今后开展全球变化对该地区生物多样性影响的研究奠定基础；同时也为秘鲁政府的决策提供科学支持，为将来建立“亚马逊热带雨林生物多样性与生态系统环境研究站”的目标打基础；通过野外调查与收集，建立可以和秘鲁方面共享的生物多样性数据库；面向秘鲁的研究学者与研究生举办能力建设培训班，加强其科研能力及两国友好关系。

亚马逊热带雨林是世界上生物多样性最丰富的地区，对该地区生物多样性的研究是理解生物多样性本质及预测全球变化对生物多样性的影响不可或缺的。秘鲁是世界上十大生物多样性热点地区之一，拥有世界上生物多样性最丰富的亚马逊热带雨林。尽管秘鲁生物多样性非常丰富，但在相关领域的研究却非常薄弱，缺乏热带雨林生物多样性本底调查。2006年9月中科院院长路甬祥访问秘鲁时，与秘鲁国家科技委员会讨论了合作领域和设想，认为双方在生物多样性领域有很好的合作前景，并签订了合作协议或谅解备忘录。在此基础上，华南植物园于2008年12月对秘鲁亚马逊流域上游Junin省的热带雨林进行了初步调查并且与秘鲁国立农业大学签署了合作研究备忘录，为下一步合作打下了良好基础。“中秘生物多样性合作研究与能力建设合作计划”的开展将进一步加强中秘生物多样性的合作研究与能力建设。