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中国科学院上海药物研究所研究员谭敏佳团队联合军事科学院军事医学研究院、国家蛋白质科学中心(北京)、国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院等团队,在国际上首次对肺腺癌开展了大规模、高通量、系统性的全景蛋白质组学研究,首次从蛋白质水平系统描绘了肺腺癌的分子图谱,并发现了与病人预后密切相关的分子特征,特别是发现了中国人群肺腺癌两个主要基因(TP53和EGFR)突变人群的蛋白质分子特征。相关研究成果近日发表于《细胞》。
据介绍,这项研究工作对103例临床病人的肺腺癌和癌旁组织进行了蛋白质表达谱和磷酸化翻译后修饰谱的深度解析,最终共鉴定到11119个蛋白质产物和22564个磷酸化修饰位点,同时整合临床信息和基因组特征数据分析,深度构建了基于蛋白质组的肺腺癌分子图谱全景。
研究人员利用蛋白质组表达谱数据将肺腺癌分为三个蛋白质组亚型(I型、II型、III型)。其中,I型与细胞代谢和肿瘤微环境密切相关,临床信息显示该型主要为临床早期人群,并且预后最好;III型与细胞稳态及增殖密切相关,其主要为临床中后期人群,呈现出肿瘤分化程度较低、基因突变负荷较高等特征,并且预后最差;II型则是I型和III型的过渡状态,这部分人群预后程度介于I型和III型之间。结合磷酸化修饰谱数据分析,此项研究还揭示不同亚型群体间激酶活性的特征,为肺腺癌的更精准分型和治疗提供依据。
“这项工作首次大规模、系统性构建了肺腺癌的蛋白全景图和蛋白质分子亚型特征,揭示了中国人肺腺癌的蛋白质分子特征及潜在的预后和诊疗生物标志物,为肺腺癌的精准医疗提供了重要资源和线索。” 军事科学院军事医学研究院、国家蛋白质科学中心(北京)贺福初院士表示,该工作是“中国人蛋白质组计划”继肝癌、胃癌工作之后取得的又一重大成果,也是中国科学家主导的“蛋白质组学驱动的精准医学”的又一次重大突破,具有广泛的社会意义,更预示着蛋白质组学在精准医学中的独特性和重要性。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.043
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